速凍食品、冷飲食品、肉蛋奶制品等加工車間與包裝間,都有比較高的衛生要求,特別是生鮮食品由于最終沒有加熱消毒工序,生產車間的微生物污染是影響產品質量的極重要因素。以前我國大都采用紫外燈消毒,由于前述紫外法殺菌天然的缺點,食品微生物指標很難控制,在夏季尤其嚴重。臭氧用于食品加工車間消毒效果很好,濃度也比冷庫消毒要求低的多,一般0.5-1.0ppm即可達到80%以上的空氣殺菌率,并可去除車間異味。蛋品加工廠生產蛋黃醬、冷飲廠生產冰激凌、雪糕,都有攪拌、膨化工序,產品與空氣強烈接觸,試用臭氧后車間微生物降低90%,產品質量達到合格標準,而一旦停止使用臭氧,產品中細菌含量逐日快速增加。